Dr. Heinz Doofenshmirtz

El Dr. Heinz Doofenshmirtz es un científico loco y "malvado". Su estado actual es divorciado y tiene una hija adolescente llamada Vanessa Doofenshmirtz. Es el jede de su propia empresa llamada Doofenshmirtz Malvados y Asociados (Pérfido Doofenshmirtz S.L en la versión cartellana), que a la vez le sirve de guarida, ubicada en el centro de la ciudad (algo que resulta cómico, teniendo en cuenta que la mayoría de los villanos se esconden en lugares en las afueras de las ciudades o en sitios de difícil acceso), e incluso tiene un tema musical, y es considerado uno de los mejores personajes de la serie.
Toda su maldad la descarga en proyectos que tienden a ser frustrados por el Agente P. El Dr. doofenshmirtz se tornó malvado debido a su triste infancia (situación que conduce a los espectadores a sentir empatía o lástima por él) pues su familia lo ignoraba y lo forzaba a situaciones humillantes, como ser el gnomo de jardín, usar ropa de mujer, etc. Es uno de los personajes más cómicos de la serie. En la película de Phineas y Ferb el Dr. Doofershmirtz se encuentra con su otro yo de la segunda dimensión el cual ha conquistado el área limítrofe y el mundo, pero el motivo de su maldad es haber perdido un tren de juguete cuando era niño. 

La silueta del edificio donde vive se parece mucho a la cabeza de Ferb.